Vzhľadom na silne alkalickú povahu roztoku hydroxidu sodného je potrebné venovať pozornosť ochrane dezinfekčného personálu počas dezinfekcie, aby sa zabránilo popáleniu ľudí a hospodárskych zvierat; Pri dezinfekcii by mali byť hospodárske zvieratá a hydina vyhnané z domu; Hydroxid sodný má horiaci účinok na kožu a orgány a nemožno ho použiť na dezinfekciu zvierat; Hydroxid sodný má korozívny účinok na textílie a hliníkové výrobky a takéto výrobky nie je možné dezinfikovať týmto liekom; Po poldennej dezinfekcii chlievov a náčinia pre hospodárske zvieratá a hydinu roztokom hydroxidu sodného je potrebné ich opláchnuť čistou vodou, aby nedošlo k popáleniu kopýt alebo kože hospodárskych zvierat a hydiny; Autá a lode prepravujúce dobytok a hydinu by sa mali dezinfikovať iba roztokom hydroxidu sodného počas 6-12 hodín a potom opláchnuť čistou vodou, aby sa zabránilo korózii a poškodeniu.
Primerane zosilnite dezinfekčný účinok. Existuje niekoľko metód na zvýšenie dezinfekčného účinku pri použití hydroxidu sodného na dezinfekciu: zahrievanie roztoku hydroxidu sodného zlepší dezinfekčný účinok a čím vyššia je teplota a koncentrácia, tým lepší je dezinfekčný účinok; Pridanie vhodného množstva chloridu sodného do roztoku hydroxidu sodného môže zvýšiť dezinfekčný účinok.